Kyohei Arita
@KyoheiArita
Professor at Yokohama City University. Research: Structural Biology (PX, SAXS, Cryo-EM), Epigenetics, DNA methylation, Histone modifications, Ubiquitination.
今回出した論文で一番好きなデータが受精過程の紡錘体と染色体の動態を詳細に捉えたこのタイムラプス動画🎥 撮るのすごく大変だった
Our paper is now published @CurrentBiology! With our unique method to live image fertilized mouse eggs, we highlighted the importance of Ca2+ oscillations in maintaining the spindle position to ensure asymmetric cell division. Thanks to all the authors! sciencedirect.com/science/articl…
日本語での公式発信はちょっと待ってな
New chapter of sex determination, with sharks and rays! Our study, utilizing embryonic samples from aquariums, revealed the ancient sex chromosome origin and unique sex determination potentials. w/ @taikinw and other talents Published today in PNAS pnas.org/doi/full/10.10…
研究期間：未定 研究内容（300文字以内）：in vitro解析 だけで通る書類って一体・・・。形だけの提出、見直してほしい
Big day for the David lab! 🎉 Our @MolecularCell paper is out today- huge congrats to first authors @IfeAkano & Jake Hebert for leading this beautiful study uncovering SMARCA3 as a novel H3 E3 ligase that shapes heterochromatin regulation in colorectal cancer 🤩
Online Now: The SWI/SNF-related protein SMARCA3 is a histone H3K23 ubiquitin ligase that regulates H3K9me3 in cancer dlvr.it/TLz0Lw
Online Now! Non-canonical functions of DNMT3A in hematopoietic stem cells regulate telomerase activity and genome integrity dlvr.it/TLz2yR #stemcells
Online Now: The SWI/SNF-related protein SMARCA3 is a histone H3K23 ubiquitin ligase that regulates H3K9me3 in cancer dlvr.it/TLz0Lw
３つのうちの１つ目が Cell Reports に掲載されました。 Miyazaki et al., Cell Reports (2025) 外膜タンパク質複合体 LptDE の成熟過程の後半において、小型タンパク質 LptM が LptD を安定化することを、クライオ電子顕微鏡解析と機能解析により明らかにしました。 cell.com/cell-reports/f…
塚崎研では、現在、発表前の論文（投稿中）を3つbioRxivにアーカイブしています。 bioRxivは生物系研究を査読前に公開するサイトです。 最先端の研究にご興味あればぜひ！ doi.org/10.1101/2025.0… doi.org/10.1101/2025.0… doi.org/10.1101/2025.0… #構造生命科学研究室 #塚崎研 #NAISTバイオ
【#論文掲載情報】 大学院生 中村菜緒さんらが筆頭著者の論文が「Structure」に掲載されました✨ 論文内容の詳細は以下のリンクからご覧ください👇(2025年7月9日プレスリリース) #横浜市立大学 #生命医科学研究科 #大学院 #理学部 #ycu #yokohamacityuniversity yokohama-cu.ac.jp/res-portal/new…
11月に開催される第98回日本生化学会大会で、横浜市大の有田さん(@KyoheiArita)と以下のテーマでシンポジウムを企画することになりました。 京都で演者のみなさんと会えるのが楽しみです！ 11月3日（月） 1S14m「生化学が切り拓くDNAメチル化研究の新展開」 aeplan.jp/jbs2025/progra…
当研究室の中村菜緒が第９回北陸エピジェネティクス研究会で学生優秀発表賞を受賞しました。 yokohama-cu.ac.jp/news/2025/2025…
有田・西山班の研究成果がStructure誌に掲載されました！ Nakamura N, Yoshimi S, Kikuchi A, Onoda H, Kori S, Nakanishi M, Nishiyama A, *Arita K. Structures of USP7 in active and inactive states bound to DNMT1 revealed by cryo-EM. Structure 33 1-9, 2025 authors.elsevier.com/a/1lPZC3SNvcEP…
自分で基質作って、脱ユビさせてます。 ユビ化H3はおそらく、リングの内側にはくっつかないと思います。今後は、基質がDNMT1からどうやって受け渡されるのか、USP7にどうやって認識されるかを可視化したいです。
おめでとうございますー。脱ユビキチン化アッセイなんて面倒そうだなと思ったら本当に面倒そうだった。 脱ユビキチン化反応が起こるときはユビキチン化H3はDUBとUBLで作るリングみたいな部分の内側にくっつくんですか？
Online now! Structures of USP7 in active and inactive states bound to DNMT1 revealed by cryo-EM dlvr.it/TLrSPD
Excited to share our new paper. Cryo-EM captures the conformational changes of USP7 during its activation. sciencedirect.com/science/articl…
こちらこそ大変勉強になりました。 今後もよろしくお願いします！
昨日午前は、本年二回目の有田研とのオンライン合同ミーティングでした。同じ分子を見てても、考え方、アプローチが違うので勉強になります。質疑も盛り上がって良かった！これからもよろしくお願いします。
A new polymer balancing biodegradability and toughness was developed via multi-objective Bayesian optimization. The work, in collaboration with Prof. Amamoto at Univ. of Tokyo, is now published in npj Computational Materials! nature.com/articles/s4152…
投稿論文のeditorからのメールが検疫されてた。何度かやり取りしてた相手なのに、なんで今さら？ 大事なやり取りが止まるのは致命的なので、うちのメールシステム改善してほしい。